傳說中可以實現持有這一切愿望的寶物——圣杯，自久一來就成為了眾多魔術師爭相追求的目標。然而，為了得到圣杯，就需要奉獻大量的魔力，于是便誕生了由7名被圣杯選出的魔術師，分別召喚出聽命于他們的7名英靈使魔（好跟不同次元的人YY），進行慘烈的廝殺祭祀儀式，這個每隔一定時間就要爆發一次的戰斗，被稱為“圣杯戰爭”。 基本沒有學習魔術的才能的魔術師衛宮士郎（后宮士郎），因為偶然的召喚出了真實身份不明的劍士Saber（咱偉大的女王大人啊啊啊啊啊！），而被卷入到了圣杯戰爭中。面對著接踵而來的各路強敵，即便無心參戰，士郎也不的不以保命為首要前提，艱難的一路戰斗下去。然而關于圣杯的真相卻令人無比震驚，隱藏在“圣杯戰爭”背后的罪惡陰謀，其真正的目的是......