1963年生于遼寧撫順，1985年畢業于中國人民大學，考入北京電影學院念研究生，后留校執教至今。
1983年起，即開始發表電影理論、評論文章，到目前為止，在海內外主要電影雜志上共發表理論、評論文章260余萬字。其中，《中國電影傾斜的起跑線》、《結構與意義》、《革命電影的修辭策略》等在海內外研究界產生影響。
1991年開始，由他擔任編劇的喜劇影片《離婚大戰》問世，受到觀眾喜愛，自此，又創作出《賺它一千萬》、《狂吻俄羅斯》、《謀刺關東王》、《怒海紅顏》、《猛警威龍辣椒妹》等影片。
1995年起，馬軍驤又開始電視劇的制作運籌工作，迄今已制作60余集電視劇。此外，他還從事小說的創作，其中，《戴高樂機場草地上的兔子》，被《新華文摘》、《中華文學選刊》等雜志轉載。
馬軍驤的影視劇創作以喜劇為主，善于展示一個平凡的小人物身處因境的窘迫和尷尬，讓觀眾在會心一笑之余品味生活的甘苦 。
自在電影學院任教以來，1991年公派赴香港中文大學講學，1993年在巴黎第八大學開設《中國電影史》課程。1997年初，又應美國賓夕法尼亞州立大學之邀，以訪問學者的身份講述《好萊塢與中國電影》。